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32 [분자 설계 및 실습] 중간 고사 대체 프로젝트 마지막 힌트
환이
47423   Oct 29, 2009
안녕하세요. 대체 프로젝트에 대해서 감을 못 잡으시는 것 같아서 마지막 힌트를 드립니다. 가장 무난한 방법은 ligand와 protein이 binding 되어 있는 pdb파일을 가지고 하는 것입니다. 예를 들면 receptor나 enzyme 종류가 편할 것 같습니다....  
31 [분자 설계 및 실습] 레포트 점수(5) 와 피드백4 번째 file
환이
45443   Oct 29, 2009
안녕하세요. 레포트 점수는 실습 시간에 말씀드린데로 내시면 다 10점 드렸습니다. 레포트 그냥 긁어서 내시면 어짜피 시험 공부 하실 때 또 공부하셔야 할겁니다. 굳이 체크하지 않았습니다. 시험 공부 어떻게 해야 하냐고 물으시는데 제가 내...  
30 [분자 설계 및 실습] 10/27-28 수업 및 공지사항
환이
44591   Oct 28, 2009
안녕하세요. 수업의 간략한 요약과 공지사항입니다. ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 먼저 27일...  
29 [분자 설계 및 실습] 중간 고사 대체 프로젝트 추가 설명 file
환이
45834   Oct 28, 2009
안녕하세요. 중간고사 대체 프로젝트를 하는데 많은 어려움이 있어 하시는 것 같아서 추가로 글을 올립니다. 중간고사 대체 프로젝트에 있어서 가장 중요한 요소는 얼마나 좋은 논문을 찾아서 타겟 프로테인을 선정하느냐 입니다. 물...  
28 [분자 설계 및 실습] 수업 자료 입니다. (10월 27-28) file
환이
46215   Oct 26, 2009
안녕하세요 이번 주 화요일과 수요일은 모두 수업으로 진행됩니다. 늦지 앉게 강의실로 가시면 됩니다. 배경을 최대한 없애려고 노력하였으나 5개 슬라이드는 그림 자체가 배경을 가지고 있어서 없애지 못했습니다. 양해해주시기 바랍니다...  
27 [분자 설계 및 실습] 실습자료(5)입니다. file
환이
48027   Oct 26, 2009
실습자료 입니다. 안 올린줄 모르고 -_-;; 늦게 올려드려서 죄송합니다.  
26 [분자 설계 및 실습] 중간 고사 대체 프로젝트 실습장 개방 시간
환이
46708   Oct 21, 2009
안녕하세요~ 실습장 개방시간은 말씀드렸던 대로 월요일에 하는 것으로 확정되었습니다. 다음 주 월요일 (10월 26일) 오전 9:00 - 12: 00(3시간), 오후 4:00 - 7:00 (3시간) 그 다음 주 월요일 (11월 2일) 오전 9:00 - 12: 00(3시간), 오후 4:0...  
25 [분자 설계 및 실습] 공지사항 및 4번째 실습 코멘트 file
환이
43830   Oct 15, 2009
안녕하세요. 공지사항 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1. 이번 주 실습했던 MD와 NMA에 대한 레포트는 2주의...  
24 [분자 설계 및 실습] 레포트 공지사항 및 점수(4) 1 file
환이
44685   Oct 15, 2009
안녕하세요. 4번 째 레포트 점수와 그에 대한 설명입니다. -평가 기준- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------...  
23 [분자 설계 및 실습] 공지사항 + 중간 고사 대체 프로젝트(수정)
환이
45296   Oct 12, 2009
안녕하세요 이번 중간고사 대체 프로젝트에 대해서 말씀 드리겠습니다. 애초에 계획한 바로는 5개의 protein을 정해서 그 protein에 대해서 알려주지 않고 지금까지 배운 method들을 이용해서 그 protein의 기능을 맞추게 하려고 하였으나 ...  
22 [분자 설계 및 실습] 실습 자료(4) 입니다. file
환이
47220   Oct 08, 2009
안녕하세요. 4번 째 실습자료입니다. 더불어 숙제에 필요한 CO 그림 파일들도 올려놓았습니다. 숙제 잘 하시고 적절한 Hint는 추후에 다들 모르실 경우에 올리도록 하겠습니다. 즐거운 하루 되시고 안녕히 계세요.  
21 [분자 설계 및 실습] 중간 고사 대체 프로젝트
환이
45402   Oct 07, 2009
안녕하세요. 중간 고사 대체 프로젝트에 대해서 간단히 설명드리도록 하겠습니다. 이번 프로젝트는 개인 프로젝트입니다. 제가 출석부 순서대로 5개의 그룹으로 나누어서 각 그룹마다 적당한 크기의 protein을 정해서 PDB 파일을 드릴겁니다. ...  
20 [분자 설계 및 실습] 10/7 수업 및 공지사항 1
환이
55809   Oct 07, 2009
안녕하세요. 아침부터 수업 듣느라 고생이 많으십니다. 7일자 수업에서는 Minimization과 GA(Genetic Algorithm)에 대해서 정리하시면 좋을 것 같습니다. Minimization의 경우는 특징을 알아두시면 좋을 것 같습니다. gradient descent나 conju...  
19 [분자 설계 및 실습] 3 번째 실습 코멘트 내용들
환이
55021   Oct 01, 2009
안녕하세요. 이번 주에도 많은 코멘트들을 달아주셔서 감사합니다. 간단하게 짚고 넘어가도록 하겠습니다. 다음과 같은 의견들이 있었습니다. -실습을 너무 빡빡하게 하지 않고 뒤에 혼자 해볼 수 있는 시간 을 달라 A: 저도 시간을 많...  
18 [분자 설계 및 실습] 레포트 공지사항 및 점수(3) file
환이
54872   Oct 01, 2009
안녕하세요. 3번 째 레포트 점수와 그에 대한 설명입니다. -평가 기준- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------...  
17 [분자 설계 및 실습] 9/30 수업 및 공지사항
환이
54942   Sep 30, 2009
안녕하세요. 오늘 배우신 내용 중에 핵심은 "MC"라고 보시면 됩니다. MC의 algorithm에 대해서 간략히 알아두시면 좋을 것 같습니다. 다른 molecular mechanics 방법들에 대해서도 정리는 해보시면 좋을 것 같습니다. 다음 주에는 화요일...  
16 [분자 설계 및 실습] 9/29 수업 및 공지사항
환이
55322   Sep 29, 2009
안녕하세요. 아침부터 수업 듣느라 고생이 많으십니다. 29일자 수업에서는 Molecular Orbital 에서의 Basis set 과 간략하게 Energy based method(?)에 대해서 배웠는데요 slater 함수를 gaussian 함수로 표현할 수 있다는 것과 왜 그렇게 하는...  
15 [분자 설계 및 실습] 수업 자료 입니다. (9/29-30) file
환이
56501   Sep 28, 2009
안녕하세요. 이번 주 수업 자료를 미리 올려 드립니다. 이번 주에 강의하실 부분은 저번 시간에 배웠던 MO에서 basis set부분(저번에 올려드린 ppt 뒷부분)과 MC와 MD에 대해서 배우게 됩니다. 미리 뽑아 오시면 강의 필기를 하시기에 좋...  
14 [분자 설계 및 실습] 3 번째 실습 데이터 분석에 관하여 1
환이
55404   Sep 25, 2009
안녕하세요 대부분 가지고 계신 summary 파일들이 VDW에너지는 그대로이실 겁니다. 이는 계산을 하기에 앞서서 minimization을 할 때 gas phase에 가장 안정한 form으로 계산을 하였기 때문인 것 같습니다. interaction energy를 계산할 ...  
13 [분자 설계 및 실습] 2 번째 실습 코멘트 내용들
환이
54325   Sep 24, 2009
feedback -중요한 부분은 한국 조교님이 다시 짚어달라. -부수적인 설명은 간략히 해달라. -실습 자료 ppt가 실제 다루는 자료와 동일하게 해달라 -실습 때 클릭하기 바쁘다, 툴의 의미를 짚어달라. -교수님 강의와 실습의 연관성을 설명해달라. ...  

  



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