안녕하세요.

 

4번 째 레포트 점수와 그에 대한 설명입니다.

 

-평가 기준-

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1. CO의 negative charge를 설명하는데 있어서 Molecular orbital 을 이용하여 분석을 하였는가

2. 분석의 경우 Octet rule만을 이용하여 설명하시면 -1점, Molecular orbital 개념이 들어갔으면 7점, 개념은 들어갔으나 내용이

이상해도 -1점. 제가 생각하는 정답은 ppt로 정리해서 올려드렸습니다.

3. HOMO, LUMO의 경우 간단히 내용 적었으면 3점입니다.
4. 좋은 코멘트 +1점, 전에 했던 코멘트와 겹치면 가산 처리 하지 않았습니다.

5. Dipeptide 관찰하고 싶은 것 정해서 가져오라고 말씀드렸는데 조사해오신분 +1점입니다.

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CO 에 대한 부가 설명

MO theory에서 bonding orbital에는 electronegativity가 높은 atom이 더 크게 기여하고 anti-bonding orbital에는 eletronegativity가 더

낮은 atom이 크게 기여합니다. 이 이유는 에너지 다이어그램 상에서 어느 atomic orbital에 molecular orbital이 가까이 있느냐가

영향을 미치기 때문입니다. 가까이 있을 수록 MO의 형성에 있어서 크게 기여를 하신다고 보시면 됩니다.

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(질문에 대한 답)

HOMO가 탄소의 p orbital에 더 가까운 에너지를 갖는다 확인을 어떻게 하나?
A: Atomic orbital의 에너지 다이어 그램에서 상대적인 위치를 가지고 판단

 

에너지 미니마이제이션과 MC

A: 이는 수업시간에 설명을 드렸었기에 간략히만 다시 정리해드리면 Minimization은 그냥 minimum으로 달려가는 공굴리기이고

MC는 이 단점을 극복하기 위해 확률적으로 올라갈 수 있는 구멍(방법)을 마련해 놓은 것이라고 생각하시면 됩니다.

 

실습에서 그림으로 보여주었던 Ramachandran energy contour 가 어떻게 그려지나
A: surfer라는 유료 프로그램을 통하여서 그렸습니다. 하지만 이는 굳이 유료 프로그램을 사용하지 않더라도

첫번 째 column에는 phi angle을, 두번 째 column에는 psi angle을, 세번 째 column에는 두 각일 때의 에너지 값을 차례로 적어 넣으신

이후에 exel에서도 다이어그램 그리기 하시면 됩니다.

대신 값을 줄 때에 첫번째와 두번째 값을 축 값으로 잡으시고 세번 째 에너지 값은 높이값인 z로 잡아주시면 됩니다.

 


*피드백과 숙제 및 중간고사 프로젝트에 대한 설명은 내일 올리도록 하겠습니다.